Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms