Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm28490A0A087WRT9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm28490A0A087WRT9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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