Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vstm4T1NXB5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vstm4T1NXB5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vstm4T1NXB5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms