Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a3S4R2P9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8a3S4R2P9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.5 ms