Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd4Q9Z2D7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd4Q9Z2D7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd4Q9Z2D7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms