Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan5Q9Z1D8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan5Q9Z1D8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zkscan5Q9Z1D8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms