Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip2Q9Z0H8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clip2Q9Z0H8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip2Q9Z0H8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip2Q9Z0H8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms