Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArcQ9WV31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArcQ9WV31 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ArcQ9WV31 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms