Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psma1Q9R1P4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psma1Q9R1P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psma1Q9R1P4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psma1Q9R1P4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms