Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plod3Q9R0E1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod3Q9R0E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms