Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek3Q9R0A5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek3Q9R0A5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek3Q9R0A5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms