Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR5

Hipk2, Homeodomain-interacting protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk2Q9QZR5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hipk2Q9QZR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk2Q9QZR5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hipk2Q9QZR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hipk2Q9QZR5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms