Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Npas3Q9QZQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms