Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc4Q9QUQ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4Q9QUQ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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