Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh5Q9QUM7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh5Q9QUM7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh5Q9QUM7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms