Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CtsmQ9JL96 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsmQ9JL96 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsmQ9JL96 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms