Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc5a3Q9JKZ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms