Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr12Q9JJA4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr12Q9JJA4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr12Q9JJA4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms