Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FliiQ9JJ28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FliiQ9JJ28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FliiQ9JJ28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FliiQ9JJ28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FliiQ9JJ28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms