Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cxcl11Q9JHH5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cxcl11Q9JHH5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cxcl11Q9JHH5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cxcl11Q9JHH5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl11Q9JHH5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms