Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actrt2Q9D9L5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms