Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TcimQ9D915 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TcimQ9D915 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TcimQ9D915 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms