Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo2Q9D8S4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo2Q9D8S4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo2Q9D8S4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms