Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc7Q9D541 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc7Q9D541 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc7Q9D541 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms