Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930578G10RikQ9D4Q4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930578G10RikQ9D4Q4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms