Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd2Q9D3B1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hacd2Q9D3B1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd2Q9D3B1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd2Q9D3B1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms