Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lmbr1lQ9D1E5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmbr1lQ9D1E5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmbr1lQ9D1E5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms