Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Susd3Q9D176 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Susd3Q9D176 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Susd3Q9D176 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms