Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrs1Q9CYH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rrs1Q9CYH6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rrs1Q9CYH6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrs1Q9CYH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1431.1 ms