Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssu72Q9CY97 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssu72Q9CY97 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssu72Q9CY97 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms