Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW2

Mrps22, 28S ribosomal protein S22, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps22Q9CXW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps22Q9CXW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrps22Q9CXW2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps22Q9CXW2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps22Q9CXW2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms