Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf138Q9CQE0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf138Q9CQE0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf138Q9CQE0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf138Q9CQE0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms