Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a5Q99NH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a5Q99NH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a5Q99NH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms