Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NsmfQ99NF2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NsmfQ99NF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NsmfQ99NF2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms