Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tm2d1Q99MB3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tm2d1Q99MB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms