Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ciao1Q99KN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ciao1Q99KN2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ciao1Q99KN2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ciao1Q99KN2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ciao1Q99KN2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms