Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lims1Q99JW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lims1Q99JW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms