Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp3Q99JB6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp3Q99JB6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms