Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY5

Kdm4b, Lysine-specific demethylase 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4bQ91VY5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4bQ91VY5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4bQ91VY5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4bQ91VY5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4bQ91VY5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms