Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PxnQ8VI36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PxnQ8VI36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PxnQ8VI36 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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