Protein–RNA interactions for Protein: Q8VH37

Hdac8, Histone deacetylase 8, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac8Q8VH37 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac8Q8VH37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac8Q8VH37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac8Q8VH37 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac8Q8VH37 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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