Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
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Vmn1r200Q8R281 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Vmn1r200Q8R281 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Vmn1r200Q8R281 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Vmn1r200Q8R281 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Vmn1r200Q8R281 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r200Q8R281 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Vmn1r200Q8R281 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r200Q8R281 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r200Q8R281 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r200Q8R281 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Vmn1r200Q8R281 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r200Q8R281 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r200Q8R281 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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