Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MyripQ8K3I4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MyripQ8K3I4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MyripQ8K3I4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MyripQ8K3I4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MyripQ8K3I4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MyripQ8K3I4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MyripQ8K3I4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MyripQ8K3I4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms