Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stn1Q8K2X3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Stn1Q8K2X3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stn1Q8K2X3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stn1Q8K2X3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stn1Q8K2X3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms