Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rftn2Q8CHX7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn2Q8CHX7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn2Q8CHX7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms