Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGD2

Crispld1, Cysteine-rich secretory protein LCCL domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crispld1Q8CGD2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crispld1Q8CGD2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crispld1Q8CGD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Crispld1Q8CGD2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crispld1Q8CGD2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms