Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28bQ8CEG5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28bQ8CEG5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc28bQ8CEG5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc28bQ8CEG5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms