Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras1Q8CEC5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkiras1Q8CEC5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nkiras1Q8CEC5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkiras1Q8CEC5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms