Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prpf31Q8CCF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf31Q8CCF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf31Q8CCF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf31Q8CCF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms