Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo48Q8CAT8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo48Q8CAT8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo48Q8CAT8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms